エラーの取得無効な Oracle URL が指定されました:OracleDataSource.makeURL

URL を 2 回間違って指定したようで、プロパティ名が正しくありません。

<property name="Url" value="jdbc:oracle:thin:@127.0.0.1:1521:XE" />  
<property name="URL" value="jdbc:oracle:thin:@127.0.0.1:1521:XE" /> 

<property name="url" value="jdbc:oracle:thin:@127.0.0.1:1521:XE" /> 

また、glassfish-resources.xml で使用できる正しいプロパティ名を取得するには、glassfish 4.1 のドキュメントを参照することをお勧めします

Glassfish 3.1 の場合、オプションは こちら