DELETE DupRows.*
FROM MyTable AS DupRows
INNER JOIN (
SELECT MIN(ID) AS minId, col1, col2
FROM MyTable
GROUP BY col1, col2
HAVING COUNT(*) > 1
) AS SaveRows ON SaveRows.col1 = DupRows.col1 AND SaveRows.col2 = DupRows.col2
AND SaveRows.minId <> DupRows.ID;
もちろん、3か所すべてのcol1、col2をすべての列に拡張する必要があります。
編集:これを保持して再テストしたスクリプトから取り出したところ、MySQLで実行されます。