MySQLとPHPでを設定するにはどうすればよいですか？

これを試してください：

    echo '<select>';
$tempholder = array();
$rs = mysql_query("SELECT * FROM id ORDER BY year");
$nr = mysql_num_rows($rs);
for ($i=0; $i<$nr; $i++){
    $r = mysql_fetch_array($rs);
    if (!in_array($r['year'], $tempholder)){
        $tempholder[$i] = $r['year'];
        echo "<option".(($year==$r["year"])? ' selected="selected"' : '').">".$r["year"]."</option>";
    }
}
unset($tempholder);
echo '</select>';

上書きする必要のある変数に状態を保存しません。

そして、本当のエラーは$ year =$ r ["year"]の単一の等号であり、残りのコードではなかったと思います。