MySQLWorkbenchはアイドル時に接続をドロップします

[編集]->[設定]->[SQLエディター]に移動すると、次のように表示されます。

DBMS connection keep-alive interval (in seconds): 600
DBMS connection read time out (in seconds): 600
DBMS connection time out (in seconds): 60

DBMS接続のキープアライブ間隔とは、Workbenchが接続を維持するためにサーバーにキープアライブ要求を送信する頻度を意味します。

5分==300秒なので、DBMS接続のキープアライブ間隔を300未満に設定します（例：250）

「250秒ごとにキープアライブリクエストを送信する」という意味になります。 [OK]をクリックします。

次に、MySQL Workbenchを終了して再起動し、変更を有効にします。

標準のTCP/IP over SSH接続方法を使用する場合は、sshServerAliveIntervalを構成することも役立ちます。