mysqltuner.pyによって発行される警告は、キャッシュがスワップされるリスクがない場合でも実際に関連しています。これについては、次のように詳しく説明されています。 http://blogs.oracle.com/dlutz/entry/mysql_query_cache_sizing
基本的に、MySQLは、キャッシュが大きいほどキャッシュのグルーミングに多くの時間を費やします。キャッシュは中程度の書き込み負荷でも非常に不安定であるため（クエリは頻繁にクリアされます）、大きすぎるとアプリケーションのパフォーマンスに悪影響を及ぼします。 query_cache_sizeを微調整します およびquery_cache_limit アプリケーションの場合、挿入あたりのヒット数が最も多い、lowmem_prunesの数が少ないブレークポイントを見つけてみてください。 また、データベースサーバーの負荷にも注意を払ってください。