SSHトンネルコンポーネントを完全に独立して実行し、SSH経由でトンネリングされたTCPを使用して、node-mysql（またはその他のSQLクライアント...）をDBにポイントできます。
このようにSSHトンネルを設定するだけです
ssh -N -p 22 [email protected] -L 33306:localhost:3306
バックグラウンドのままにしておきます（このような記事 詳細については）
次に、MySQLクライアントをローカルホストのポート33306に送信します。実際には、リモートサーバー上にあり、ポート3306を使用しているかのように接続されます。