最終的な解決策は単純でした。
MySQL5.5からエクスポートします。 （エクスポートファイルは114 GBです）
MySQL 5.5をアンインストールします（すべてのデータファイルを削除します）
MySQL5.6をインストールする
データのインポート
MySQL 5.6からエクスポート（エクスポートファイルは13 GBになりました）
MySQL 5.6をアンインストールします（すべてのデータファイルを削除します）
MySQL5.6をインストールする
データのインポート
最終的な解決策は単純でした。
MySQL5.5からエクスポートします。 （エクスポートファイルは114 GBです）
MySQL 5.5をアンインストールします（すべてのデータファイルを削除します）
MySQL5.6をインストールする
データのインポート
MySQL 5.6からエクスポート（エクスポートファイルは13 GBになりました）
MySQL 5.6をアンインストールします（すべてのデータファイルを削除します）
MySQL5.6をインストールする
データのインポート