テーブルから*を削除しても機能しません

あるべきです

$stmt = $mydb->prepare("DELETE FROM messages WHERE from_user = ?  AND id = ? ");

そして、mysqli_*を使用していただきありがとうございます 非推奨のmysql_*の代わりに機能

さらに、*があってはなりません DELETEの場合;それは正しい構文ではありません。

参照：

• https://dev.mysql.com/doc/ refman / 5.0 / en / delete.html

* 構文はSELECTと組み合わせて使用​​されます：

• https://dev.mysql.com/doc/ refman / 5.0 / en / select.html