MySQLのコンマ区切り文字列内の値を置き換えますか？

うーん...多分これ？

SELECT @before := CONCAT(SUBSTRING_INDEX(`columnname`,',',3),','),
       @len := LENGTH(SUBSTRING_INDEX(`columnname`,',',4)+1
FROM `tablename` WHERE ...;

SELECT CONCAT(@before,'newstring',SUBSTRING(`columnname`,@len+1)) AS `result`
FROM `tablename` WHERE ...;

必要に応じて交換しますが、それで十分です。

編集 ：1つのクエリにマージ：

SELECT
    CONCAT(
        SUBSTRING_INDEX(`columnname`,',',3),
        ',newstring,',
        SUBSTRING(`columnname`, LENGTH(SUBSTRING_INDEX(`columnname`,',',4)+1))
    ) as `result`
FROM `tablename` WHERE ...;

その+1 +2である必要がある場合があります 、わかりませんが、うまくいくはずです。