この問題に対する私の解決策:問題を2つに分けました。
これで、テーブルSとEの両方に共通のルートがあり、各テーブルのIDを使用してサブクエリを結合することにより、このすべての共通のルートを取得します。重複するルートがあるため(同じ:S.num、S.company、stops.name、 E.num、E.company)私はDISTINCTを使用しました。
SELECT DISTINCT S.num, S.company, stops.name, E.num, E.company
FROM
(SELECT a.company, a.num, b.stop
FROM route a JOIN route b ON (a.company=b.company AND a.num=b.num)
WHERE a.stop=(SELECT id FROM stops WHERE name= 'Craiglockhart')
)S
JOIN
(SELECT a.company, a.num, b.stop
FROM route a JOIN route b ON (a.company=b.company AND a.num=b.num)
WHERE a.stop=(SELECT id FROM stops WHERE name= 'Sighthill')
)E
ON (S.stop = E.stop)
JOIN stops ON(stops.id = S.stop)