Sphinx Search/MySQLは最も一般的な単語を検索します

はい。これは非常に簡単です。 --buildstopsと--buildfreqsflagsを使用してインデクサーでそれらを構築します。

indexer --config /path/to/sphinx.conf  indexName --buildfreqs --buildstops freq_wordlist.txt 100000

この例では、スフィンクスインデックスの最初の100000語が、頻度順に並べられています。