codeigniter上に構築されたPHPアプリがMySQLとmongoDBデータベースに同時に接続することは可能ですか？

はい、これは箱から出して可能です。

構成で2つのグループを定義する必要があります。1つはmysql用、もう1つはmongodb用です。アプリケーションでは、これらのデータベースをグループ名で読み込むことができます。

confugration.php内：

$db['mysql']['hostname'] = "localhost";
$db['mysql']['username'] = "root";
$db['mysql']['password'] = "";
$db['mysql']['dbdriver'] = "mysql";
//... (full config omitted for brevity)

$db['mongodb']['hostname'] = "localhost";
$db['mongodb']['username'] = "root";
$db['mongodb']['password'] = "";
$db['mongodb']['dbdriver'] = "mongodb";
//... (full config omitted for brevity)

次に、次のようにデータベースをロードします。

$mysqlDB = $this->load->database('mysql', TRUE);
$mongoDB = $this->load->database('mongodb', TRUE); 

複数のデータベースに接続する方法 のユーザーガイドをご覧ください。 および構成グループを指定する方法 。