この単純なMySQLクエリが行を返さないのはなぜですか？

NULLをチェックする方法がおそらく問題です。 MySQLでは、次のことを試してください。

SELECT `id` FROM `users` WHERE `username` = "test" AND `id` IS NOT NULL;

NULLと空の文字列を確認するには、次を使用できます。

SELECT `id` 
FROM `users` 
WHERE `username` = "test" 
AND (`id` IS NOT NULL OR `id` != "");