2つのテーブルからSQLを選択すると、重複する値が返されます-Codeigniter

暗黙の結合が行われたため、これは正常です。テーブルごとに1つずつ、合計2つのクエリをリクエストしてから、結果を1つの配列にマージしてみませんか？

public function getcentrelist()
{
    $this->load->database();
    $query_courses=  $this->db->query('SELECT course_name as name from tbl_training_courses');  
    $query_centers=  $this->db->query('SELECT centre_name as name from tbl_traning_centres'); 
    $courses = $query_courses->result();
    $centers = $query_centers->result();
    return array_merge($courses,$centers);
}

フィールドcourse_nameとcenternameの名前を統一された名前「name」に変更したことに注意してください。これは、一貫性のあるマージされたテーブルを作成するために必要です。