設定テーブルの列-：setting_id | settings_code | settings_name | settings_description
ユーザーテーブルの列-：user_id | user_name | user_password | etcetera
ユーザー設定テーブルの列-：user_setting_id | user_id_fk | settings_code_fk | settings_value
そのような構造：
ユーザー->ユーザー設定<----設定
これがお役に立てば幸いです。