ORDER BYでCASE関数を使用するにはどうすればよいですか？

CASEは機能しますが、ENDがありません 。ただし、この場合は、IF(AcceptedAnswerId = Id,1,0)を使用することもできます。 。

あなたが示す単純なケースでは、あなたはできた ただ：

order by type,if(type=0,(@accepted:=acceptedanswerid),id<>@accepted),timestamp

しかし、それがあなたの実際のケースでうまくいくかどうかはわかりません。