SQLServerExpressローカルDBランタイムの紹介のプレゼンテーションを参照してください-優れた概要を説明します。
LocalDBの大きな利点は、実際のSQLServerであるということです。これはSQLServer Expressの特別なバージョンですが、基本的には、「実際の」SQL Serverが持つすべての機能（空間データ型、ストアドプロシージャ）をサポートします。
一方、SQL Server Compact Editionは、非常に縮小されたバージョンです。多くの機能とデータ型はサポートされていません。小さくて「アジャイル」ですが、パンチが足りません。
私は個人的に、SQL ServerCE4よりもLocalDBランタイムを備えたSQLServerExpressを選択します。ただし、SQL Server CEの小さなサイズが特に必要な場合を除きます（モバイルデバイスなど）。
また、ErikEJの優れた Everything SQL Server Compact上のSQLServerCE 3.5、CE 4.0、SQL Server Express 2008 R2、およびSQL Server 2012ExpressLocalDBの比較も参照してください。 Webサイト。