主キーとしての Entity Framework 6 GUID:値 NULL を列 'Id' に挿入できません。テーブル 'FileStore' 列は null を許可しません

これらの属性を Id 列に追加することに加えて、

[Key][DatabaseGenerated(DatabaseGeneratedOption.Identity)]public Guid Id { get;設定; }  

 移行では、 CreateTable を変更する必要があります defaultValueSQL を追加するには 列へのプロパティ、つまり:
 
Id =c.Guid(nullable:false, identity:true, defaultValueSql:"newsequentialid()"),  

 これにより、コメントで指摘したように、Code First では避けたいデータベースに手動でアクセスする必要がなくなります。