「GROUPBY」句を使用する場合は、集計関数でグループ化されていないすべての列を囲む必要があります。 GROUP BYリストにタイトルを追加するか、代わりに「min(a.title)」を選択してみてください。
SELECT COUNT(t.tag), a.title FROM a_tags t
JOIN w_articles2tag a2t ON a2t.tag = t.id
JOIN w_article a ON a.id = a2t.article
WHERE t.tag = 'css' OR t.tag = 'php' GROUP BY t.tag, a.title LIMIT 9