現在は、Npgsqlの最新のベータバージョン http://pgfoundry.org/frs/download.php/3494/Npgsql2.0.13.91-bin-ms.net4.5Ef6.zip そして、あなたは変える必要があります
<provider invariantName="Npgsql" type="Npgsql.NpgsqlFactory, Npgsql" />
に
<provider invariantName="Npgsql" type="Npgsql.NpgsqlServices, Npgsql" />