JOINでUNNESTを使用する

技術的には、クエリは次のように機能する可能性があります（このクエリの目的については完全にはわかりません）：

SELECT 9 AS keyword_id, count(DISTINCT m.id) AS total, t.parent_id AS tag_id
FROM  (
    SELECT  unnest(m.taglist) AS tag_id
    FROM    mentions m
    WHERE   m.search_id = 3
    AND     9 = ANY (m.taglist)
    ) m 
JOIN   tags t  USING (tag_id) -- assumes tag.tag_id!
GROUP  BY t.parent_id;

しかし、あなたはここで間違った方向に進んでいるように私には思えます。通常、冗長配列taglistを削除します正規化されたデータベーススキーマを保持します。そうすれば、元のクエリはうまく機能するはずですが、エイリアスを使用して構文を短縮するだけです：

SELECT 9 AS keyword_id, count(DISTINCT m.id) AS total, t.parent_id AS tag_id
FROM   mentions m
JOIN   taggings mt ON mt.mention_id = m.id
JOIN   tags     t  ON t.id = mt.tag_id
WHERE  9 = ANY (m.taglist)
AND    m.search_id = 3
GROUP  BY t.parent_id;

謎を解き明かす

<rant> 「異なる結果」の根本的な原因は、一部の知的に挑戦されたORMの不幸な命名規則です。人々に課す。
私はid 列名として。複数のテーブルがあるデータベースでは、このアンチパターンを使用しないでください。そうです、それは基本的に任意を意味しますデータベース。たくさんのテーブルに参加するとすぐに（それがデータベース内）idという名前の列の束になります。まったく意味がありません。
tagという名前のテーブルのID列 tag_idである必要があります （別の説明的な名前がない限り）。 idは絶対にしないでください。</rant>

クエリが誤ってtagsをカウントします mentionsの代わりに：

SELECT 25 AS keyword_id, count(m.id) AS total, t.parent_id AS tag_id
FROM  (
    SELECT unnest(m.taglist) AS id
    FROM   mentions m
    WHERE  m.search_id = 4
    AND    25 = ANY (m.taglist)
    ) m
JOIN   tags t USING (id)
GROUP  BY t.parent_id;

このように機能するはずです：

SELECT 25 AS keyword_id, count(DISTINCT m.id) AS total, t.parent_id
FROM  (
    SELECT m.id, unnest(m.taglist) AS tag_id
    FROM   mentions m
    WHERE  m.search_id = 4
    AND    25 = ANY (m.taglist)
    ) m
JOIN   tags t ON t.id =  m.tag_id
GROUP  BY t.parent_id;

DISTINCTも追加し直しました count()にクエリの途中で失われました。