次のようにクエリを作り直してみてください:
EXECUTE 'update '|| (schemanm||'.'||tname)::regclass ||' set ' || quote_ident(cname) ||' = ''NaN'' WHERE '|| quote_ident(cname) ||' = 999;'
regclass
にキャストするため 登録された関係内を検索しようとしています。スキーマは関係ではありません。
または、
EXECUTE 'update '|| quote_ident(schemanm)||'.'||quote_ident(tname) ||' set ' || quote_ident(cname) ||' = ''NaN'' WHERE '|| quote_ident(cname) ||' = 999;'