MongoDB：大文字と小文字を区別しないクエリを作成することは可能ですか？

正規表現を使用できます。

あなたの例では、次のようになります：

db.stuff.find( { foo: /^bar$/i } );

ただし、値を見つけるたびに追加のコストを負担するのではなく、途中で値を小文字にする（または大文字にする）ことができるかもしれません。明らかに、これは人の名前などでは機能しませんが、タグのようなユースケースかもしれません。