mongodbはフィールド値を比較して検索します

$ whereを使用してこれを行うことができます：

db.coll.find( { $where: "this.field1 > this.field2" } );

しかし：

Javascriptの実行はネイティブ演算子よりも遅くなりますが、非常に柔軟性があります

パフォーマンスが問題である場合は、@yi_Hが提案する方法を採用することをお勧めします。