MongoDBの公式C＃ドライバーを使用して「ID」で1つの「ドキュメント」を削除するにはどうすればよいですか？

それがあなたのやり方です。これはご存知だと思いますが、1行にまとめたい場合は、組み合わせてクエリ変数を定義する必要はありません。

collection.Remove(Query.EQ("_id", a.Id));