MongoDBは、日時をUTCで保存します。そのため、保存する前にISTからUTCに変更されます。 ISTオフセットはUTCから+05:30です。したがって、日付時刻10/03/2016 00:00:00は、2016-10-02T18:30:00.000Zに戻ります。これは、UTCでの同じ日時です。
クライアントに提示する前に、MongoDbからデータをフェッチしている間、時間をISTに戻す必要があります。
ところで、最初から日時をISO形式で保存してみてください。
詳細については、日付 のMongoDBドキュメントページをご覧ください。