実際に必要なのは、古いデータをアーカイブすることです。 mongodbメーリングリストでこのスレッドを確認することをお勧めします：
https://groups.google.com/forum/#!topic/mongodb-user/rsjQyF9Y2J4
マイケル・ディロルフ（10gen）からの最後の投稿は、次のように述べています。
したがって、単一のコレクションを使用でき、適切なインデックスで作業できると思います。
とにかく、コレクションが大きくなりすぎる場合は、いつでも手動のアーカイブプロセスを実行できます。