ネストされたフィールドの値でフィールドを更新します

$arrayElemAt を使用できます または $ first （v4.4）配列から最初の要素を選択する演算子

db.players.update(
  { username: "moshe" },
  [{ 
    "$set": { 
      "health": {
        "$arrayElemAt": ["$Chapters.Cat A", 0]
      }
    } 
  }]
)

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