主な問題は、コレクション全体を処理する必要があることです(この状況では、プロセスを高速化するためにインデックスを使用できません)。
このコードを試すことができます(操作が少ない):
db.getCollection('User').aggregate([
{
$unwind: "$UserSubscriptions"
},
{
$group: {
_id:"$UserSubscriptions.Subscription.Publication.Code",
users: {$addToSet: "$_id"}
}
},
{
$project: {"PublicationCode": "$_id", "Count": {$size: "$users"}}
}
])