mongoクエリ-オブジェクトの配列から特定のオブジェクト（その `_id`は既知）を取得しますが、この配列はドキュメントのリストの一部でもあります

MongoDBスクリプトを使用するのか、アプリ言語を使用するのかわかりません（間違っている場合はNodejs）

これがMongoシェルスクリプトでの動作です

db.MODEL.find( { _id: DOCUMENT_ID },
                     { inbox: { $elemMatch: { _id: MESSAGE_ID } } } )

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これが希望どおりでない場合は、投稿を更新して、使用している言語/フレームワークを追加してください