Tomcatはgdk_custom.jarを見つけることができません、Oracleはそれを作成できませんか？

gdk_custom.jarを作成する必要はありません 。

必要なのは、Tomcatがそれを探さないようにすることだけです。 Tomcat 8.0.38以降 デフォルトでをスキャンしています 。スキャンをオフにする必要があります。したがって、過度の警告が多く表示されることはなく、サーバーの起動が速くなります。

tomcat/conf/context.xmlに次の行を追加します ：

<Context>
  ...
  <JarScanner scanManifest="false"/>
</Context>