MySQL LOAD DATA INFILE（小数点記号としてコンマを使用）

'、'を'に置き換えてみてください。ロード時。

例-

LOAD DATA INFILE 'file.csv' INTO TABLE dados_meteo
(@var1, @var2)
SET column1 = REPLACE(@var1, ',', '.'), column2 = REPLACE(@var2, ',', '.')