MySQLdb Pythonは％dと％sを挿入します

クエリの実行中はクエリ全体を文字列形式にする必要があるため、%s 使用する必要があります...

クエリが実行された後、整数値が保持されます。

だからあなたのラインはそうあるべきです。

.execute("INSERT INTO table VALUES(%s,%s)", (int(id), string))

説明はこちら です。