MySQLのテーブルの行数を制限できますか？

非常に正当な理由がない限り、SQLテーブルの行数を制限することはお勧めしません。次のようなクエリを使用したほうがよいようです：

select top 1000 entityID, entityName from TableName

テーブルの行を物理的に制限するのではなく。

ただし、本当に1000行に制限したい場合：

delete from TableName where entityID not in (select top 1000 entityID from TableName)