ER_NOT_SUPPORTED_AUTH_MODE：クライアントはサーバーから要求された認証プロトコルをサポートしていません。 MySQLクライアントのアップグレードを検討してください

同じ問題がありました。

MySQLWorkbench をインストールします

次のクエリを実行します：ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED WITH mysql_native_password BY '123456789'; MySQLWorkbenchで

Node.jsに戻り、ファイルの実行を再試行してください。少なくとも私にとってはうまくいくはずです。