パラメーター化されたクエリ を作成してみてください
私は休止状態の第一人者ではありませんが、これでうまくいく可能性があります:
session.createSQLQuery("LOAD DATA INFILE :file INTO TABLE prod CHARACTER SET latin1 FIELDS TERMINATED BY ';' LINES TERMINATED BY '\n' IGNORE 1 LINES;")
.setString("file", "E:/uploaded/NumSerie/NS/NumSerie.txt")
.executeUpdate();