chrom_only
クロム22の値しかないため、結合のインデックス選択が不適切になる可能性があります。
私がこの権利を解釈した場合、start_end
を使用すると、クエリが高速になるはずです。
SELECT `inVar`.chrom, `inVar`.pos, `openChrom_K562`.score
FROM `inVar`
LEFT JOIN `openChrom_K562`
USE INDEX (`start_end`)
ON (
`inVar`.chrom=`openChrom_K562`.chrom AND
`inVar`.pos BETWEEN `openChrom_K562`.chromStart AND `openChrom_K562`.chromEnd
)