mysqlのREGEXPを使用して2つの解決策を見つけました
(1)
`favourite_id` REGEXP '[[:<:]]1[[:>:]]|[[:<:]]2[[:>:]]|[[:<:]]3[[:>:]]' //faster then below
(2)
`favourite_id` REGEXP '(^|,)(1|2|3)(,|$)' //slower then above
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