NodeJS：コードでデータベースに接続する場所は？

node.jsのパフォーマンスの鍵は、スレッドをブロックしないことです。

var result = db.query(query);

大きな違いです。

db.query(query, function(result) {
  res.send(result);
});

リクエストのクエリを処理する方法です

一度接続すれば問題ありません。ほとんどのデータベースではキューに問題はありません。