WindowsGUIツールからリモートLinuxサーバー上のMySqlデータベースに接続できません

一般に、パブリックアクセス用に（またはIP制限がある場合でも）ポート3306を開くことはお勧めしません。私は個人的に常にポート3306をPutty/sshでトンネリングし、ローカルホストを使用してデータベースに接続します。

この場合、次のようにユーザーに特権を付与することを忘れないでください：

grant all privileges on yourDatabaseName.* to 'yourUserName'@'localhost' identified by "yourUsersPassword";

それでも直接接続したい場合は、ユーザーがまだ十分な権限を持っていない可能性があります。これを試すことができます：

grant all privileges on yourDatabaseName.* to 'yourUserName'@'yourClientsIp' identified by "yourUsersPassword";