ユーザー入力を変換する必要があります。LOOKS LIKE関数はありません。 MySQLで :)
文字変換された文字列を元の文字列と一緒に保存し、 php ::translit> これを行うには：
id data trans_data 1 Москва MOSKVA 2 София SOFIA
SELECT *
FROM table
WHERE trans_data LIKE CONCAT('%', ?, '%')
mysqli->bind_param('s', strtoupper(transliterate('Москва')));