mysqli_queryから成功/失敗の応答を取得します

mysqli_error()を使用できます エラーが発生したかどうかを確認する

if (mysqli_error($runcheck ))
{
   // an error eoccurred
}

特定の例では、行が前に存在するかどうかを確認する方が適切です。 挿入を行います。あなたの例は近いですが、 mysqli_num_rows() ：

$check = "SELECT * FROM jos_activeagents WHERE AGENTUID = '".$agt."'";
$runcheck = mysqli_query($link,$check);
if (mysqli_num_rows($runcheck) > 0)
{
    // username in use
}