mysql_real_escape_stringは十分ではありませんか？

メソッド名からの推論queryAsArray 、このDbBaseを使用しているようです MySQL関数のマニュアルページのコメントからのクラス 。もしそうなら、それはquery エスケープされた引用符からエスケープ文字を削除するメソッド：

function query($sql, &$records = null){
    $sql = str_replace(array('\\"', "\\'"), array('"', "'"), $sql);
    // …
}

次に、あなたの例が機能するのは奇跡ではありません（私はそれを単純化しました）：

$input = "', BAD SQL INJECTION --";

$sql = "SELECT '".mysql_real_escape_string($input)."'";
var_dump($sql);  // string(33) "SELECT '\', BAD SQL INJECTION --'"
//                      everything’s OK ↑

$sql = str_replace(array('\\"', "\\'"), array('"', "'"), $sql);
var_dump($sql);  // string(32) "SELECT '', BAD SQL INJECTION --'"
//                                Oops! ↑