列挙された列を使用したデータベース設計の代替手段であり、パフォーマンスが低下します

PRIMARY KEY (`expressionId`),
UNIQUE KEY `geneId` (`geneId`,`conditionId`),

使用

PRIMARY KEY(`geneId`,`conditionId`),
INDEX (`expressionId`),

他のテーブルがexpressionIdを防御していない場合 、その列とその上のインデックスを削除します。

なぜこれが役立つのですか？データは主キーでクラスター化されます。 geneIdでデータを検索しています 、これはPKの開始です。したがって、特にテーブルがinnodb_buffer_pool_sizeよりもはるかに大きい場合は、データをより効率的にフェッチできます。 （これはRAMの約70％である必要があります）。