mysqladmin
を使用してみませんか コマンド?
mysqladmin -u root -p'oldpassword' password newpass
これは、他のユーザーのパスワードを変更するためにも使用できます:
mysqladmin -u sql_username -p oldpassword password newpass
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mysqladmin -u root -p'oldpassword' password newpass
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mysqladmin -u sql_username -p oldpassword password newpass