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nginxとユニコーンを介してRailsアプリにアクセス中にMysql2エラーが発生しました

上記のコメントで述べたように、capistranoの移行拡張機能を削除した後、データベースとフォルダーをクリアし、展開を再実行しました。すべてが正常に機能しました。