MySQLが返された配列のすべての列のエントリを複製しないようにするにはどうすればよいですか？

おそらくこれは、mysql_fetch_arrayを使用した後に発生しています。 （または同様のもの）。

返す配列型を指定するフラグを追加する必要があります。そうしないと、PHPは両方を想定します。

つまり、mysql_fetch_array($result_set, MYSQL_ASSOC|MYSQL_NUM|MYSQL_BOTH)