グループごとに不足している日付を埋める

data.tableを使用できます Rから 。 'time'列が'Date'クラスであると仮定すると、

library(data.table)#v1.9.5+
DT1 <- setDT(df1)[, list(time=seq(min(time), max(time), by ='day')),
                    by =.(shop_id, item_id)]
setkeyv(df1, names(df1)[1:3])[DT1][is.na(value), value:=0]
#   shop_id item_id       time value
#1:     150       1 2015-07-10     3
#2:     150       1 2015-07-11     5
#3:     150       1 2015-07-12     0
#4:     150       1 2015-07-13     2
#5:     150       2 2015-07-10    15
#6:     150       2 2015-07-11     0
#7:     150       2 2015-07-12    12

開発バージョンでは、「キー」を設定せずにこれを行うこともできます。開発バージョンをインストールする手順は、hereです。

 df1[DT1, on =c('shop_id', 'item_id', 'time')][is.na(value), value:=0]
 #   shop_id item_id       time value
 #1:     150       1 2015-07-10     3
 #2:     150       1 2015-07-11     5
 #3:     150       1 2015-07-12     0
 #4:     150       1 2015-07-13     2
 #5:     150       2 2015-07-10    15
 #6:     150       2 2015-07-11     0
 #7:     150       2 2015-07-12    12

または、@ Arunが提案したように、より効率的なオプションは

 DT1[, value := 0L][df1, value := i.value, on = c('shop_id', 'item_id', 'time')]
 DT1