plpgsql変数を使用してn_distinctを設定するときにエラーが発生しました

これは仕様によるものです。マニュアルでは、可変置換の章で説明しています。 ：

変数の置換は現在、SELECTでのみ機能します 、INSERT 、UPDATE 、およびDELETE これは、メインSQLエンジンがこれらのコマンドでのみクエリパラメータを許可するためです。他のステートメントタイプ（一般にユーティリティステートメントと呼ばれる）で非定数の名前または値を使用するには、ユーティリティステートメントを文字列およびEXECUTEとして作成する必要があります。

できません EXECUTEを使用して動的ステートメントの値をパラメーター化します 動的コマンドの実行の章を引用しているためです。 ：

パラメータシンボルのもう1つの制限は、SELECTでのみ機能することです。 、INSERT 、UPDATE 、およびDELETE コマンド。他のステートメントタイプ（一般にユーティリティステートメントと呼ばれます）では、値が単なるデータ値であっても、テキストで値を挿入する必要があります。

唯一のオプション plpgsql関数では、値をコマンド文字列に連結します。 format()を使用できます 、ただし、単純な例では、単純な連結は安全で簡単です::

CREATE OR REPLACE FUNCTION pg_temp.setdistinct(_cnt real)
  RETURNS void
  LANGUAGE plpgsql AS
$$
BEGIN
   EXECUTE 'ALTER TABLE _temp ALTER COLUMN id SET (n_distinct=' || _cnt || ')';
END
$$;

スキーマ修飾pg_temp. 質問を反映した（文書化されていない！）「一時的な」機能にします。
n_distinctに関するマニュアル 。