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トランザクションをコミットする必要があります。
conn.commit()
トランザクションが失敗すると考える理由がない場合は、forループの終了後にコミットする方が高速です。
PDO::fetchAllとPDO::fetchのループ
PDOプリペアドステートメントを使用して複数の行を挿入します
1つの列が複数の列に移動するようにSQL結果を転置する
c#を使用して.SQLスクリプトファイルを実行する方法